带有光遗传功能的光纤记录系统，通过定制的特殊光纤，使得光遗传的刺激光和光纤记录系统的荧光激发光在荧光探测光路中互不影响；将光遗传刺激光和荧光激发光调制到不同的频率上，然后对特定频率的荧光信号解调输出，从而排除光遗传刺激光对光纤记录系统的影响;通过此系统可同时实现光遗传刺激和多种荧光信号的记录。此套光纤记录系统可配置不同波长的激光器耦合进光路，在记录荧光信号的同时，对不同蛋白进行激活或抑制实验。